L’ÉPUB compte 4 districts francophones et 2 districts néerlandophones. La paroisse est représentée par le ou la pasteur(e) et deux membres à l’Assemblée de District.
Le district de Liège réunit 18 paroisses. L’Assemblée de District élit ses représentants à l’Assemblée Synodale composée d’une centaine de membres votants.
L’Assemblée Synodale est l’instance supérieure de l’ÉPUB. Elle prend des décisions et formule des recommandations en vue de l’édification et du rayonnement de l’Église. Elle détermine sa politique financière et en fixe le budget. Entre deux sessions de l’assemblée synodale, le Conseil Synodal se charge d’exécuter ses décisions et de traiter ses recommandations. En résumé, l’ÉPUB fonctionne selon le système appelé : presbytéro-synodal.
Le ou la pasteur(e)
Le pasteur, homme ou femme, est élu par l’assemblée d’église. Il ou elle est nécessairement détenteur d’un Master en théologie protestante délivré ou reconnu par la Faculté Universitaire de Théologie Protestante de Bruxelles.